基本上若是只有公魟发情而母魟尚未成熟，公魟会追咬母魟，但是母魟因为还没成熟所以不会配合公魟飞起来让公魟顺利完成交配，最后可能演变成母魟被咬到怕了会贴在缸壁不敢乱动。如严重者会导致拒食后身亡，另若是母魟成熟发情了公魟也成熟了，但是很多公魟没经验不知道该如何追咬才会让母魟飞起来或是母魟飞起来却不知道该怎麼将生殖器放入母魟泄殖孔，这也会造成交配不成功，母魟被咬后，轻则皮肉之伤，重则会细菌感染. 因此选择一只会交配的公魟会比选择母魟重要。
饲养观赏鱼最大的乐趣莫过於观察它们繁殖的过程，以及享受收成小鱼的乐趣；同样地，饲养虹鱼的朋友也一定很想让自己家中的爱鱼能够成功的在水族箱中繁殖出下一代。虽然淡水虹鱼进入香港,大陆的水族市场已经有一段时间了，能够有规模进行商业性繁殖的业者实在不多，而许多虹鱼爱好者也曾经收成过小虹鱼，但大部分都是在不明不白的情况下就生了，而对其中的过程与细节都没有观察到，也不甚了解。繁殖虹鱼的秘诀到底在那里？ 虹鱼的体盘尺寸从30CM到300CM都有，而一般常被饲养的种类至少也有35CM以上，所以想要繁殖虹鱼必定要准备够大的水族箱。水族箱的底面积比高度来的重要，毕竟虹鱼是属於底楼性的鱼类。体盘直径不超过45CM的种类可以使用180CM*70CM的水族箱比较理想，更大的虹鱼则是要使用水池比较恰当。有了饲养的场所，接下来就要准备种鱼了。
大多数的淡水虹鱼会在二至三岁是达到性成熟，淡水虹鱼是少数卵胎生的淡水鱼。如同孔雀鱼及大部分的鲨鱼，卵胎生的鱼种都会有交配动作，而且必须要进行体内受精，所以雄鱼的臀鳍都会演化成棒壮的交接器，如此才能有效地把精子注如母鱼的体内，而不是象卵生鱼类那样把精子撒在水中。硬骨鱼类卵胎生鱼（例如花糨类及南美四眼鱼）是公鱼只有一个交接器，而软骨鱼类的鲨鱼及虹鱼有一对交接器，这一点与硬骨鱼类卵胎生鱼是非常不同的。正确区分公鱼与母鱼是在准备繁殖前最重要的工作之一，还好这一点对於想要繁殖虹鱼的人来说是十分容易的。
人工饲育下的虹鱼并没有明显的繁殖季节，只要环境适宜，一年四季都有受孕铲子的机会。对大多数曾经繁殖过虹鱼的人而言，收成小虹鱼都是在无预期的状态下发生的，所以既是要纪律繁殖的过程也无从下手。其实成熟的虹鱼在繁殖前是会有一些徵兆可寻的，如果能细心观察，就不难发现自己饲养的虹鱼的不是已经正准备交配或已身怀六甲了。
虹鱼的繁殖主要由母鱼主导，发情的母鱼释放出费洛蒙（pheromone)吸引成熟又有能力的公鱼并同时选择交配的对象，在此一至三周的期间内（视品种及鱼只状况而宜）受到费洛蒙刺激的公鱼会表现的很有活动力，并追逐发情的母鱼，这一点是非常容易观察得到的。追逐中的公鱼常会咬母鱼，这虽然不算是攻击行为，但也很容易在母鱼的体盘边缘留下咬伤的痕迹，有时候甚至会把母鱼的体盘或尾鳍咬下一块儿造成严重受伤。交配后的公鱼会持续跟随在母鱼身边准备进行下一次的交配，同时要驱赶想要接近母鱼的其他公鱼。 在怀孕期间，母鱼在外观上并不会有明显不同，活动力及食欲也不会有变化。由於虹鱼是卵胎生的鱼类，发育中的受精卵并不依靠母体提供养分，不过随著受精卵的发育，怀孕的母鱼必须花费更多的体力去支撑日益增重的身躯，所以母鱼会从怀孕中期开始增加进食量以补充热量，同时活动力也开始下降。如果仔细观察母鱼便不难发现：北部脊椎两侧也会随著怀孕的时间而隆起，并会出现胎动的现象。虹鱼的怀孕期视品种的不同而有所不同，但整体平均而言会维持在3~5个月之间。
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